植物资源 全县有林地164万亩，有植物920余种。可供开发的植物资源主要有：毛竹、杉、松、苦槠、红楠等用材植物；深山含笑、木莲、春兰等芳香植物；山苍子、山胡椒、大叶樟、小叶樟、肉桂等樟科植物；山楂、猕猴桃、黑木耳、香菇、长根菇等食用野果及菌类植物；桅子、枳壳、七叶一支花、厚朴、八角莲、玉竹等药材和观赏植物及油茶等经济植物。
动物资源 有国家一级保护动物金钱豹、草鹗、白鹇、黄腹角雉；二级保护动物穿山甲、刺猬、红腹锦鸡、蟒蛇、猕猴；三级保护动物大鲵（娃娃鱼）、小灵猫（黄鳅狸）、水獭、猫头鹰等。
矿产资源 主要有钨、铅、锌、铜、钼、银、镉、铋、锡、铁、金、稀土、瓷土、莹石、石灰石、水晶石、钾长石、煤等。
地表水资源 年每平均径流量35.2亿立方米，丰年径流量达43.2亿立方米，特枯年份径流总量也有16.5亿立方米，每亩耕地可分摊年径流量8620立方米，高于全国平均水平。这对发展农业、渔业、生活生产提供了有利条件。由于径流丰沛，河流多，落差大，所以水能资源丰富。全县河流总落差达2255.1米，水能资源蕴藏量19.7万千瓦。
地下水 主要为松散类孔隙水、基岩裂隙水及地下热水。地下热水己发现较大的有3处：一处是平富乡下寨村暖塘的温泉，在海拔420米的山岭下面，温泉处海拔300米，水温39.5℃，流量2.81升／秒。另一处是五指峰乡热水村的温泉，在海拔500米的山岭下，温泉处海拔415米，水温44℃，流量1.627升／秒。两处都是利用水热给水浮莲和非洲鲫鱼越冬。热水村建有非洲鲫鱼种繁殖场。还有一处是东山镇中稍村温泉，已正在筹建天沐温泉休闲风景区。此外，五指峰乡的双宵村及其北面的轿子顶山，也有小股温泉。
