中共赣州市上犹生态环境局党组原名为中共上犹县环境保护局党组，经2020年12月24日县委常委会第92次会议通过，同意更名为中共赣州市上犹生态环境局党组。

2019年，按照机构改革有关要求，县（市、区）生态环境管理工作体制由市、县（市、区）分级管理调整为省以下垂直管理。

赣州市上犹生态环境局于2019年7月29日正式挂牌成立，为赣州市生态环境局正科级派出机构，领导职数核定为1正2副；下属事业单位2个，分别为：赣州市生态环境技术服务中心上犹技术服务站、赣州市生态环境保护综合执法支队上犹大队，均为公益一类事业单位，均核定副科级领导职数1名。现核定编制共48个（其中行政编制7个，工勤编制1个，全额拨款事业编制40个），现有在编人员41名，其中行政编制6名，工勤编制1名，事业编制31名。